GB/T 38481-2020.Determination of ultralow-frequency mutations for microorganisms-Duplex sequencing.

1范围

GB/T 38481规定了用双重测序法测定微生物超低频突变的方法。

GB/T 38481适用于微生物基因组或基因片段超低频突变的测定。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T 6682分析实验室用水规格和试验方法

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

超低频突变 ultralow-frequency mutations

化学、物理或生物因素导致微生物DNA发生的频率低于1X 10-的永久性改变。

3.2

条形码标签 barcode label

接在待测DNA片段两侧的核苷酸片段,用以标示同一扩增家族的DNA.协助进行突变位点的确认。

3.3

互补标签家族 complementary tag family

所有含两端互补条形码标签的DNA片段。

3.4

双链同源序列 double-strand consensus sequences;DCSs

带有相同条形码标签的双链DNA序列,包含反向互补链。

4原理

在待测DNA片段两端接上一段12 nt随机且互补的双链核苷酸条形码标签,然后对所有带有条形码标签的序列进行双重的高通量测序。利用12 nt随机互补标签，排除掉测序文库制备过程中所引入的突变,进而准确检测突变位点和突变率。

5试剂

除非另有规定,仅使用分析纯试剂。

5.1 水。GB/T 6682,一级。

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